1. Masa Awal (1968–1970) – Lahirnya PGAA
Madrasah Aliyah Negeri Purwakarta berakar dari berdirinya Pendidikan Guru Agama Atas (PGAA) 6 tahun pada tahun 1968. Gagasan pendirian muncul dari para tokoh agama dan masyarakat Purwakarta yang prihatin terhadap kebutuhan guru agama dan pendidikan Islam lanjutan pada masa itu.

Peresmian perdana diadakan di Bioskop Priangan pada Februari 1968 dengan sekitar 80 siswa. Tokoh penting pada periode awal ini antara lain:

Sayuti Sirajudin, B.A. – Kepala madrasah pertama.
H. Endang Iskandar – Salah satu penggagas dan penggerak.
BPH 5 – Panitia pembina yang membantu administrasi dan pengembangan.
Fasilitas masih sangat sederhana; kegiatan belajar-mengajar memanfaatkan ruang darurat dan peralatan terbatas.

2. Masa Peralihan (1970–1980-an) – Perpindahan dan Penataan
Dalam beberapa tahun pertama, PGAA Purwakarta sempat berpindah lokasi ke Asrama Polisi (ASPOL) dan gedung-gedung sementara. Upaya ini dilakukan agar kegiatan pembelajaran dapat terus berjalan sembari menunggu pembangunan gedung permanen.

Kebijakan pemerintah melalui KMA No. 40/1979 yang menata ulang lembaga Pendidikan Guru Agama memicu transformasi struktur menjadi Madrasah Aliyah Negeri. Pada fase ini, pengelolaan mulai diarahkan langsung di bawah Kementerian Agama, dan kurikulum disesuaikan dengan standar nasional.

3. Peresmian Sebagai MAN dan Penguatan Identitas (1990-an)
Memasuki 1990-an, lembaga ini secara resmi dikenal sebagai Madrasah Aliyah Negeri Purwakarta. Lokasi tetap ditetapkan di Jl. Veteran No. 299, Purwakarta. Pembangunan ruang kelas baru, laboratorium IPA, dan perpustakaan mulai dilakukan. Madrasah juga memperkuat identitas keislaman melalui kegiatan keagamaan rutin dan program pembinaan akhlak.

4. Era Modern (2000–sekarang)
Seiring perkembangan zaman, MAN Purwakarta mengadopsi teknologi informasi dan metode pembelajaran modern. Beberapa tonggak penting antara lain:

Penguatan Ekstrakurikuler: Pramuka, Rohis, Paskibra, seni hadroh, olahraga, dan KIR (Kelompok Ilmiah Remaja).
Akreditasi dan Prestasi: Mendapatkan akreditasi A serta mencetak prestasi di tingkat kabupaten, provinsi, dan nasional.
Kerja Sama Pendidikan: Bermitra dengan perguruan tinggi dan lembaga pendidikan lain dalam program literasi digital dan riset siswa.
Prestasi Internasional: Pada 2025, dua lulusan MAN Purwakarta berhasil meraih beasiswa penuh di universitas luar negeri, menandakan kualitas pendidikan yang semakin diakui.
Fasilitas terkini mencakup laboratorium komputer, perpustakaan digital, masjid madrasah, ruang multimedia, serta lingkungan belajar yang kondusif.